间变淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase, ALK）基因是非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer, NSCLC）的重要驱动靶点。肿瘤中含ALK重排的患者可从ALK 酪氨酸激酶抑制剂（tyrosine kinase inhibitor, TKI）治疗中获益, 但是靶向治疗的临床疗效在不同患者间存在明显差异^[1]。有研究报道不同ALK变体患者靶向治疗的临床疗效不同, ALK的变体形式可能是导致疗效差异的重要原因^[2]。因此有必要研究分析肺癌患者ALK基因的临床特征和复杂性。

广东省肺癌研究所对2011年1月至2013年2月期间的1 474例中国肺癌患者的标本进行了ALK基因重排的临床特征分析, 并深度分析了ALK基因重排方式的复杂性和序列多样性。所有标本均采用标准聚合酶链反应（polymerase chain reaction, PCR）和cDNA末端快速扩增（rapid amplification of cDNA ends, RACE） PCR两种方法同时检测ALK基因的重排, 然后随机选择15例ALK重排阳性的RACE-PCR产物, 挑选分子克隆分析ALK重排的复杂性。

研究结果发现, ALK重排在NSCLC的发生率为5.1%（71/1 387）, 54例小细胞肺癌和33例来源于其他器官的转移性肺癌中均没有发现ALK基因重排。在NSCLC中, ALK重排多见于年轻（P< 0.001）、女性（P=0.007）、非吸烟（P=0.001）、腺癌（P≤ 0.001）、Ⅲ B-Ⅳ 期（P=0.009）的患者, 而且ALK重排的发生与表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor, EGFR）基因突变相互排除（P< 0.001）。ALK重排的发生率在大手术标本和穿刺标本间没有发现差异。

在71例ALK阳性NSCLC患者中, EML4-ALK融合基因V1（39.4 %）和V3（32.4 %）变体的发生率最高, 非EML4融合伴侣的ALK重排发生率为5.6%。有6例患者标本同时存在EGFR基因突变和ALK融合的共存, 发生率为8.5%（6/71）。有2例存在不同的ALK变体共存, 1例为V1和V9变体共存, 1例为V3和V2变体共存, 不同ALK变体共存的发生率为2.8%（2/71）。进一步通过分子克隆发现15例阳性标本中有2例在同一标本中存在不同的ALK变体亚型共存, 1例为V1 变体的三种亚型共存即E13; A20、E13del63; A20 和 E7E12E13; A20。另1例为V3变体的三种亚型共存即E6; A20、E6ins33; A20和E3E6; A20。亚型共存在NSCLC的发生率为13.3%（2/15）。

本研究在大数据样本中分析了ALK重排的发生率和各种变体的分布, 与EGFR突变在东方亚裔人群显著高于欧美人群不同, ALK重排在东西方人群报道结果一致。同时分析了ALK重排在中国人群的临床特征, 与已有报道基本一致, 好发于年轻、非吸烟的晚期腺癌患者, 但目前关于性别的报道还不一致, 我们的结果显示女性肺癌患者更易发生ALK重排。更重要的是首次从三个方面深度分析了ALK重排的复杂性和序列多样性：（1）EGFR基因突变和ALK基因融合可共存; （2）不同的ALK变体可共存; （3）不同的ALK变体亚型可共存。分析认为同一标本中不同变体共存可能来源于不同的肿瘤细胞, 而相同变体的不同亚型共存可能来自同一细胞转录水平上不同的变体片段。

本团队Lei 等^[3]分析了本研究期间ALK阳性患者变体之间的靶向治疗效果, 发现V1变体和非V1变体间的临床疗效未见明显区别, 因此本研究未进一步直接分析ALK变体间临床疗效的差异性。另外, 在2例ALK亚型共存的标本没有不同ALK变体共存, 也没有EGFR突变共存, 且2例患者均未服用ALK TKI, 导致不能进行不同亚型间的临床疗效比较, 需要进一步扩大样本量进行分析。